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30款生物醫(yī)學(xué)常用軟件,(pcr引物設(shè)計、文獻管理、流程圖繪制...)

時間:2020-06-03 18:35 點擊次數(shù): 更多 pcr引物設(shè)計 文章
 生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域中常用專業(yè)軟件共計30款,百度搜不到建議淘寶。

按照軟件功能分類,共分為8類

1.文獻管理與分析
2.分子生物學(xué)綜合軟件
3.大分子二維/三維結(jié)構(gòu)繪圖軟件
4.質(zhì)粒繪圖軟件
5.引物設(shè)計軟件
6.凝膠分析軟件
7.代謝網(wǎng)絡(luò)和信號傳導(dǎo)分析軟件
8.流程圖繪制軟件

接下來給大家列出每個類別下具體的軟件名稱

1、文獻管理與分析

EndNoteX7,文獻管理軟件,平時方便論文管理,寫文章的時候插入文獻也是相當(dāng)?shù)姆奖悖?br /> RefViz2.1,文獻分析軟件,與EndNote結(jié)合使用,分析文獻,可以省掉大把自己看自己歸納的時間;
NoteExpress,國內(nèi)最專業(yè)的文獻檢索與管理系統(tǒng),完全支持中文,NoteExpress可以幫助您通過各種方途徑高效,自動的搜索(含互聯(lián)網(wǎng)),下載,管理文獻資料和論文;

2、分子生物學(xué)綜合軟件

Vector NTI 11.5.1,分子生物學(xué)的綜合軟件,什么功能幾乎都全了;
BioEdit7.0.9.0,雜七雜八的功能湊在一起的一個分子生物學(xué)軟件,有些罕見的Vector NTI所所沒有的功能;
DNAMAN 6.0,與Vector NTI類似的一個軟件,但是圖型化上做的很差,集成度和序列的管理功能比Vector NTI差的不是一點點,罕用,但有時候有些序列的格式非得要用它的樣子排,沒有辦法;
DNAstar v7.1,核彈級綜合性序列工具軟件,功能很廣,名氣很大。囊括分子生物學(xué)領(lǐng)域大多數(shù)內(nèi)容;
SSRHunter 1.3 ,南京農(nóng)大金陵研究院李強編寫的SSR ( Simple SequenceRepeat,即簡單序列重復(fù),又稱微衛(wèi)星DNA )位點查找軟件;
chromas ,基因測序峰圖查看軟件;
3、大分子二維和三維結(jié)構(gòu)繪圖軟件
PyMol 0.99 ,是一個處理分子結(jié)構(gòu)的軟件,經(jīng)常用在蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)分析上面的神奇的就在于它可以編輯小范圍內(nèi)的結(jié)構(gòu);
DeepView ,曾經(jīng)叫做Sus-PdbViewer,是由瑞士日內(nèi)瓦分子生物服務(wù)證的ExPASy設(shè)計的,也叫DV或SPV ,是一種界面友好,基于計算機應(yīng)用,功能強大的三維圖形軟件工具。
RNA Draw 1.1 , RNA和DNA二級結(jié)構(gòu)的分析軟件,可以分析做PCR的時候的引物的二聚體,更直觀一些;
4、質(zhì)粒繪圖軟件
SimVector4.6:與PrimerPremier同一家公司的軟件,畫質(zhì)粒的一個軟件,效果還行,與VectorNTI畫出來的風(fēng)格不一樣,有的雜志喜歡;
bvplasmid:質(zhì)粒繪圖免費軟件;
Winplas:是一個質(zhì)粒繪圖的專業(yè)軟件,功能強大,而且極易上手,它可以繪制出具有發(fā)表質(zhì)量的質(zhì)粒圖譜??蓮V范應(yīng)用于論文、教程的質(zhì)粒插圖;

5、引物設(shè)計軟件
Primerpremier5,引物設(shè)計軟件,大家都用,我也用;
Oligo7.37,引物設(shè)計軟件,大家都用,我還用,設(shè)計FusionPCR和In-Fusion連接的引物的時候,比Primerpremier直觀一些,內(nèi)附注冊機,可用;
PrimerExpress3.0,由ABI公司設(shè)計開發(fā),是Real-timePCR引物設(shè)計強大工具,3.0版本設(shè)計的引物能適用于不同品牌大部分的機型;
FastPCR5.4,一款快速設(shè)計各種類型PCR引物(簡并引物),還包括一些常用的DNA與蛋白序列軟件工具。

6、凝膠分析軟件
BandScan5.0,是一個很常用的凝膠圖像分析軟件,可用于瓊脂糖凝膠電泳,SDS-PAGE及及轉(zhuǎn)到膜上的WesternBlot,NorthernBlot,EMSA等的相對定量分析;
QuantiScanv3.0,使用簡單功能專一的凝膠掃描、分析軟件;
QuantityOne4.6.2,BioRad的凝膠成像儀自帶的電泳圖像軟件,算很好上手的了;
Gel-Proanalyzer,是由美國MediaCybernetics公司所推出的專業(yè)圖像分析軟件。軟件功能強大,單向電泳分析專家自動化程度高,高效泳道識別,分析數(shù)據(jù)無縫連接EXCEL數(shù)據(jù)文件。自帶可編程數(shù)據(jù)庫??煞治鼍溆洈?shù)、斑點雜交;
PDQuest8.0.1Advance,Bio-Rad公司推出的PDQuest分析軟件,含5種功能:成像系統(tǒng)控制功能+二維凝膠分析功能+數(shù)據(jù)庫管理功能+SpotCutter切膠系統(tǒng)控制功能+質(zhì)譜數(shù)據(jù)反饋功能;
imagelab3.0,從BIO-RAD公司培訓(xùn)人員那搞到的凝膠圖形分析軟件。據(jù)說是目前存在的唯一可以用的免費imagelab軟件,而且是中文版的,同時兼容不同類型的電腦系統(tǒng)。

7、代謝網(wǎng)絡(luò)和信號傳導(dǎo)分析軟件
CellNetAnalyzer6.0,以前叫FluxAnalyzer,基于MatLab的代謝網(wǎng)絡(luò)和信號傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)分析模塊,大部分論文中的代謝網(wǎng)絡(luò)分析都是或明或暗的用這個分析的;
Pathway_Builder_Tool,信號通路畫圖軟件;

8、流程圖繪制軟件
SmartDraw11,畫流程圖和一些復(fù)雜的示意圖;
ConceptDraw7.5Professional,SmartDraw在接下來一段時間內(nèi)的強有力的競爭對手;

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